1926年的10月10日，南方之强厦门大学成立国学研究院，云集了鲁迅、林语堂、孙伏园等一批国学大师；2006年的10月10日，我校隆重纪念国学研究院成立80周年，同时宣布复办国学研究院，打造中国南方地区不可替代的国学研究中心。
复办的国学研究院将以朱子学为学术研究重点。第一重点是以朱熹理学为研究核心，探索唐宋以来中国南方思想文化、政治社会、民生经济、宗教习俗等各领域的演变发展，形成国学研究的东南特色。第二个重点是研究在朱熹与闽学影响下的闽台及周边区域的历史、文化、社会诸特征，尤其注重对东南海洋带文化传承的探讨，以构建国学研究的东南风格。
李建发副校长说，将以招收一批研究生为主流特色，同时考虑向社会开放进行普及教育。国学研究院将继承传统，通过跨学科的学术渗透，融合哲学、历史学、宗教学、考古学、民族学、人类学、语言文字学、文学艺术学等各个门类优势，进行学术创新，开拓新领域。
厦门大学国学研究院于1926年10月10日成立，是继北大国学门、清华大学国学院之后成立的专门国学研究机构，由第一任校长林文庆任院长，语言学家林语堂任总秘书，语言学家沈兼士任研究主任，当时国学院聚集着鲁迅、林语堂、沈兼士、顾颉刚、孙伏园等一大批中外著名国学学者，当时媒体甚至称其为“大有北大南移之势”。
由于经济和主要研究学者离去等方面的原因，老国学研究院只办一学期就停办了。但它不仅把中国南方的国学研究推入一个历史高峰阶段，而且开创了泉州学、闽南文化等独特的研究领域，是20世纪前半叶中国仅有的4所国学专门研究机构之一。
[陈挺 王瑛慧 转自海峡都市报]