我校台湾研究院长年研究台湾选举的准确度，向来居中国大陆各学术及情资单位之冠。从国共内战之后，一直是中共培养涉台人才的重镇。该所因地利之便，且研究起步最早，对台湾研究相当深刻。早年包括该所所长陈孔立、范希周、李强等人奠定不错的研究基础，至于现任院长刘国深则是中生代研究台湾的佼佼者。这次，我校台湾研究院在大选之前即预估，台湾选民投票率为79.27％，而马萧胜选比率将达到16.74％，换算成蓝绿实际得票数的差距约在230万票左右，距离实际数字极为接近。
实际从事预估民调工作的台湾研究院两岸关系研究所副所长张敦才则表示，他们之所以能够掌握这次台湾选战结果，主要有几项因素，包括从基本盘来看，蓝大于绿，其次从台湾内部五大民调机构的相关数据来看，大体也呈现这种态势。在整个选战过程的造势、文宣、组织动员等环节，都是蓝营稳居上风；而从固票、催票、拉票、绑票的动作来看，绿营纵使有若干作为，还是不敌蓝营的根深柢固。再就内部气势论之，蓝营的团结远胜于绿营。再就投票率与得票率的历届选票的走向来看，得出上述的精确数字，其实并不令人意外。
张敦才表示，目前大陆涉台部门对于这次选战结果，“估计还是肯定的。原因在于马英九未必会统，但一定不会独；而谢长廷正好相反，民进党未必会独，但肯定不会统。这也说明了大陆对这两人的基本态度。”马英九胜选之后，张敦才认为两岸关系应该会比现在好得多。现在，大陆涉台部门正在积极解读马英九选战白皮书中所提及的二十几项有关于两岸的政策，并逐步分析里头涉及的五百多项具体政策，希望在2005年胡锦涛和连战两人所建构的“国共合作平台”的基础上，逐步推动相关政策。
张敦才继续指出，这些政策包括台湾松绑大陆来台投资上限、开放大陆人士来台旅游、全面进行文化交流以及两岸各级学校的交流互动等，都是大陆观察马英九上台后是否对于大陆释出善意的重要指标。“大陆对于马英九的信心基本上还是较高的，毕竟马英九的意识型态较为温和，或许这人有机会把台湾社会和两岸关系带上一条比较理性的道路。”
（原文详见http://mag.udn.com/mag/newsstand/storypage.jsp?f_ART_ID=117112）